Parted có một số giới hạn. Ví dụ, chương trình không thể thay đổi kích cỡ các phân vùng NTFS mà không có các công cụ phụ trợ, như gói ntfsprogs. Có nghĩa rằng mọi người phải sử dụng tổ hợp rất nhiều công cụ để sửa lỗi đĩa cứng trước khi dùng parted nếu muốn phân vùng lại một đĩa cứng bị hư hại. Để vượt qua trở ngại này, rất nhiều đĩa cứu hộ đã đóng gói kèm các công cụ phụ trợ cần thiết thành một đĩa CD khởi động được, cho phép thay đổi kích cỡ nhiều định dạng hệ thống tệp.

Parted không thể làm việc với các phân vùng ext2fs có các thuộc tính mở rộng, như trong SElinux. Các thuộc tính này cần được loại bỏ trước khi dùng với parted.